Секвенирование APERIOMICS

Тема в разделе "Секвенирование ДНК", создана пользователем Василий, 20 дек 2017.

  1. Василий

    Василий Active Member

    Сообщения:
    457
    Адрес:
    Россия г.Москва
    Метагеномное секвенирование ДНК и РНК

    всем на заметку!
    есть способ доставить биоматериал из России в США на секвенирование в aperiomics.
    Группа с анг. форума делает секвенирование плазмы, набирают людей.

    Цена вопроса на данный момент со скидкой в $200 получается $1500, без скидки $1700, начинали они с 1200$, но теперь подняли.


    Принимают любой биоматериал в принципе, но их директор посоветовала плазму.

    поправка - 1500$ это за РНК и ДНК, по отдельности цена - ДНК - $700, РНК - $1000.


    HOME PAGE:

    https://aperiomics.com
     
    Последнее редактирование: 11 янв 2018
  2. Хлеб

    Хлеб Administrator

    Сообщения:
    2.714
    В каком виде они предоставляют результат? Кто-нибудь с англ. группы делал?
    Нам нужно знать количество найденного в биоматериала.
    Если они делают не шотганметагеномное, то это будет список микробов, которые есть в биоматериале (если они делают стандарт). Без количества.
    Что с этим потом делать?
     
  3. Василий

    Василий Active Member

    Сообщения:
    457
    Адрес:
    Россия г.Москва
    Пример результатов анализа из aperiomics
     

    Вложения:

    • Results (5).pdf
      Размер файла:
      110,6 КБ
      Просмотров:
      26
  4. Хлеб

    Хлеб Administrator

    Сообщения:
    2.714
    Как-то не густо.
     
  5. Хлеб

    Хлеб Administrator

    Сообщения:
    2.714
    Биопсию бы из нескольких мест, а не кровь, мочу и кал.
     
  6. Василий

    Василий Active Member

    Сообщения:
    457
    Адрес:
    Россия г.Москва
    Иностранцы сдавали слюну и мочу. Теперь им предложили плазму крови сдавать.
    Почему именно биопсию? если заражение идет через слюну и другие жидкости, значит в них тоже оно есть.
     
    Lexa нравится это.
  7. Lexa

    Lexa Active Member

    Сообщения:
    801
    Адрес:
    mars
    Сообщение с ихнего форума свежее
    ...
    Я женщина и испытываю почти все симптомы, которые вы испытываете, кроме того, что вместо белого языка у меня синдром сжигания рта [​IMG]. Это было очень плохо. Я не могу позволить себе секвенирование ДНК и РНК, поэтому я поговорил с Chrystal at Aperiomics, и она сказала, что возможно узнать, какой у меня патоген, если я делаю только ДНК за 500 долларов. Надеюсь, мы сможем получить ответы. Она также сказала мне, что в четырех экземплярах, которые они собирали у людей с такими же симптомами, они заметили грибы и паразиты. (Я думаю, это хорошая новость, что у нас нет вируса)
     
    Василий нравится это.
  8. Василий

    Василий Active Member

    Сообщения:
    457
    Адрес:
    Россия г.Москва
    В их базе нет нашего патогена. Иностранцы сдавали пока общего нет, сейчас планируют поиск делать неизвестных патогенов.
     
    Mark нравится это.
  9. Василий

    Василий Active Member

    Сообщения:
    457
    Адрес:
    Россия г.Москва
    http://aperiomics.com/. В базе у них 33,000 организмов, с заграницей работают. Присылают материалы для доставки проб в том числе для биопсии вместе с обратным конвертом, обратно идет день (FedEx Overnight). Кровь больше не делают, только плазму, для этого надо будет чтоб какая-то лаборатория отцентрифужила вашу кровь или своя центрифуга-сепаратор. Слюну берут мазком, но под оптовый заказ могут работать с клиентом над альтернативными методами.
     
  10. Imya Otchestvo

    Imya Otchestvo Member

    Сообщения:
    34
    Адрес:
    Moscow
    Там именно шотган. Предоставляют не только выписку по найденным микроорганизмам, но RAW data, если попросить. https://github.com/undiagnosed/metagenomics/wiki Здесь народ выкладывает результаты и ищет пересечения. http://forums.phoenixrising.me/index.php?threads/peer-to-peer-metagenomics-investigation.55756/ здесь обсуждение. undiagnosed - программист толковый и сам вроде писал прогу по анализу raw
     
    Lexa и Василий нравится это.

Поделиться этой страницей

Яндекс.Метрика