Секвенирование ДНК биоматериала. Казань

Тема в разделе "Исследования в СНГ", создана пользователем Хлеб, 10 ноя 2019.

  1. Хлеб

    Хлеб Administrator

    Сообщения:
    3.381
    Некоторые заболевшие обратили внимание на скопление необычной слизи, которая выходит из разных мест.

    1. Семенная жидкость.
    sperma_sgustkami.jpg

    2. Вытянуто банками. Какой-то микроорганизм, окруженный слизью.

    Screenshot_20191028-154441_Telegram.jpg




    Про идею отсеквенировать биоматериал разговор уже был давно, но все никак не доходило до этого дело. Но вот недавно Соня созвонилась с представителем организации в Казани, а Дамир и Юля съездили на встречу с микробиологом. В итоге они готовы отсеквенировать эту *медузу*.

    Выдержка из переписки с микробиологом.
    Юля, я не медик. Базу мы используем NCBI (международную), содержащую геномные данные всех организмов. Список патогенов прислать не смогу. Мы не занимаемся клиническими исследованиями (диагностикой), у нас используются методы секвенирования для идентификации культивируемых микробов (в том числе грибов) или для определения состава сообщества (метагеномный анализ). Эти методы применимы только для научных целей, т.е сказать что у вас "хорошее" или "плохое" сообщество мы пока не сможем, так как еще не определена норма для этого показателя. Я готова с Вами встретиться и поделиться всеми своими знаниями, возможно удастся помочь с клиниками, в которых применяются инновационные технологии. Но боюсь как биолог, я не смогу самостоятельно глубоко раскопать причину заболевания.

    На секвенирование необходима сумма от 50 до 90К. Уже собрано 7.000 руб. Кто желает помочь, форма для приема средств в правом углу форума, либо напрямую на карту (данные карты для перевода скину в ЛС).
     
  2. Oleg696

    Oleg696 Member

    Сообщения:
    119
    Адрес:
    Калининград
    В настоящий момент собрано 20 000 рублей
     
  3. Oleg696

    Oleg696 Member

    Сообщения:
    119
    Адрес:
    Калининград
    20 500 рублей собрано.
     
  4. Хлеб

    Хлеб Administrator

    Сообщения:
    3.381
    Добрый день. Да, прислали фото после окрашивания. Но по ним трудно что-то понять неспециалисту. Главное, комментарии спеца. В жидкой составляющей ничего ДНК-содержащего нет. В сгустке что-то есть, прокрашивается. Но слой был толстый, структуру не видно, просто есть местами свечение от красителя, который красит ДНК. Специалист говорит, возможно, фибробласты. Сгусток мы делили на три части, одна ушла при попытке выделить ДНК, вторая аликвота пошла на окраску и микроскопирование, должен остаться еще кусочек. Можно попробовать еще какой-то метод выделения ДНК.
     
  5. Хлеб

    Хлеб Administrator

    Сообщения:
    3.381
    [30.12, 13:58] Попробуем еще один набор для выделения ДНК из тканей. Но у нас биоматериала осталось на 1 попытку. Потом попробуем поставить ПЦР. Если поднимется ПЦР продукт, просеквенируем.
    [30.12, 14:38] Хорошо, тогда пробуем еще раз выделить, уж что выйдет то выйдет.
     
  6. Хлеб

    Хлеб Administrator

    Сообщения:
    3.381
    [13.01, 19:27] Мы попробуем еще раз выделить ДНК и поставить ПЦР. Сегодня у меня человек заболел, не вышел на работу. Как выйдет, сразу приступим.
    [13.01, 19:28] Хорошо, спасибо, буду ждать новостей от Вас
     
  7. Хлеб

    Хлеб Administrator

    Сообщения:
    3.381
    Здравствуйте. Со второй попытки немного удалось выделить ДНК. ПЦР с грибными праймерами не дала продукта, но с человеческими и
    бактериальными праймерами ПЦР прошла. Т.е. грибной ДНК в тотальной фракции нет. Продукт гена 16s рРНК (бактериальный) попробуем просеквенировать.
     
  8. serg28

    serg28 Administrator

    Сообщения:
    2.226
    Адрес:
    Санкт-Петербург
    Болен:
    с 91 г.
    пример ответа из Казани
    секвенирование по гену s16 с предварительным ПЦР (бактериальный праймер), биоматериал - вытяжка из лимфы

    таксономические категории (в данном листинге это сокращения перед ладинскими названиями в листинге) :
    p - тип — phylum
    c - класс — classis
    o - отряд — ordo
    f - семейство — familia
    g - род — genus
    s - вид — species

    #в Порядке уменьшения количества
    1 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Gammaproteobacteria;o__Enterobacteriales;f__Enterobacteriaceae;Other;Other 0,418348331
    2 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Betaproteobacteria;o__Burkholderiales;f__Alcaligenaceae;g__Achromobacter;s__ 0,086736595
    3 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Betaproteobacteria;o__Burkholderiales;f__Comamonadaceae;g__Comamonas;s__ 0,061285342
    4 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Betaproteobacteria;o__Burkholderiales;f__Comamonadaceae;g__Delftia;s__ 0,038496353
    5 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Gammaproteobacteria;o__Enterobacteriales;f__Enterobacteriaceae;g__;s__ 0,034130238
    6 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Gammaproteobacteria;o__Pseudomonadales;f__Moraxellaceae;g__Acinetobacter;s__ 0,023427932
    7 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Betaproteobacteria;o__Burkholderiales;f__Oxalobacteraceae;g__Ralstonia;s__ 0,023374687
    8 k__Bacteria;p__Actinobacteria;c__Actinobacteria;o__Actinomycetales;f__Microbacteriaceae;g__Agromyces;s__ 0,018369629
    9 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Bacilli;o__Bacillales;f__Bacillaceae;Other;Other 0,017996912
    10 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Alphaproteobacteria;o__Rhizobiales;f__Methylobacteriaceae;g__Methylobacterium;s__ 0,01687876
    11 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Alphaproteobacteria;o__Sphingomonadales;f__Sphingomonadaceae;g__Sphingomonas;s__ 0,01677227
    12 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Alphaproteobacteria;o__Caulobacterales;f__Caulobacteraceae;g__Brevundimonas;s__diminuta 0,011873702
    13 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Alphaproteobacteria;o__Rhizobiales;f__Aurantimonadaceae;g__;s__ 0,010862041
    14 k__Bacteria;p__Bacteroidetes;c__Bacteroidia;o__Bacteroidales;f__Bacteroidaceae;g__Bacteroides;s__ 0,010489324
    15 k__Bacteria;p__Actinobacteria;c__Actinobacteria;o__Actinomycetales;f__Streptomycetaceae;g__Streptomyces;s__ 0,010010117
    16 k__Bacteria;p__Actinobacteria;c__Actinobacteria;o__Actinomycetales;f__Propionibacteriaceae;g__Propionibacterium;s__acnes 0,009584154
    17 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Alphaproteobacteria;o__Rhizobiales;f__Brucellaceae;g__Ochrobactrum;s__ 0,009584154
    18 k__Bacteria;p__Cyanobacteria;c__Chloroplast;o__Streptophyta;f__;g__;s__ 0,009104946
    19 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Alphaproteobacteria;o__Rhizobiales;f__Bradyrhizobiaceae;g__Bradyrhizobium;s__ 0,007347852
    20 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Alphaproteobacteria;o__Caulobacterales;f__Caulobacteraceae;g__;s__ 0,006016719
    21 k__Bacteria;p__Actinobacteria;c__Actinobacteria;o__Actinomycetales;f__Corynebacteriaceae;g__Corynebacterium;s__ 0,005697247
    22 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Bacilli;o__Bacillales;f__Bacillaceae;g__;s__ 0,005537511
    23 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Alphaproteobacteria;o__Rhizobiales;f__Bradyrhizobiaceae;Other;Other 0,004898568
    24 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Alphaproteobacteria;o__Sphingomonadales;f__Sphingomonadaceae;g__Sphingomonas;Other 0,004845322
    25 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Clostridia;o__Clostridiales;f__[Tissierellaceae];g__Anaerococcus;s__ 0,004259624
    26 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Clostridia;o__Clostridiales;f__Ruminococcaceae;g__Faecalibacterium;s__prausnitzii 0,004206379
    27 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Alphaproteobacteria;o__Rhizobiales;f__Bradyrhizobiaceae;g__;s__ 0,004153133
    28 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Bacilli;o__Bacillales;f__Staphylococcaceae;g__Staphylococcus;Other 0,004046643
    29 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Gammaproteobacteria;o__Alteromonadales;f__[Chromatiaceae];g__Rheinheimera;Other 0,004046643
    30 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Clostridia;o__Clostridiales;f__Lachnospiraceae;g__;s__ 0,003940152
    31 k__Bacteria;p__Actinobacteria;c__Actinobacteria;o__Actinomycetales;f__Microbacteriaceae;g__Mycetocola;s__ 0,003886907
    32 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Bacilli;o__Lactobacillales;f__Streptococcaceae;g__Streptococcus;s__ 0,003673926
    33 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Alphaproteobacteria;o__Sphingomonadales;f__Sphingomonadaceae;g__Sphingobium;s__xenophagum 0,003194718
    34 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Betaproteobacteria;o__Burkholderiales;f__Oxalobacteraceae;g__;s__ 0,003194718
    35 k__Bacteria;p__Bacteroidetes;c__Bacteroidia;o__Bacteroidales;f__Porphyromonadaceae;g__Porphyromonas;s__ 0,003141473
    36 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Clostridia;o__Clostridiales;f__Clostridiaceae;Other;Other 0,003088227
    37 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Betaproteobacteria;o__Burkholderiales;f__Comamonadaceae;g__;s__ 0,003088227
    38 k__Bacteria;p__Actinobacteria;c__Actinobacteria;o__Actinomycetales;f__Micrococcaceae;g__;s__ 0,003034982
    39 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Alphaproteobacteria;o__Rhizobiales;f__Methylobacteriaceae;g__Methylobacterium;s__adhaesivum 0,002928492
    40 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Gammaproteobacteria;o__Xanthomonadales;f__Xanthomonadaceae;g__Stenotrophomonas;s__ 0,002875246
    41 k__Bacteria;p__Bacteroidetes;c__Cytophagia;o__Cytophagales;f__Cytophagaceae;g__Dyadobacter;s__ 0,002768756
    42 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Gammaproteobacteria;o__Pseudomonadales;f__Pseudomonadaceae;Other;Other 0,002662265
    43 k__Bacteria;p__Actinobacteria;c__Actinobacteria;o__Actinomycetales;f__Nocardioidaceae;g__;s__ 0,002555774
    44 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Clostridia;o__Clostridiales;f__Veillonellaceae;g__Megamonas;s__ 0,002502529
    45 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Bacilli;o__Bacillales;f__Staphylococcaceae;g__Staphylococcus;s__ 0,002449284
    46 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Gammaproteobacteria;o__Pseudomonadales;f__Pseudomonadaceae;g__Pseudomonas;s__ 0,002342793
    47 k__Bacteria;p__Actinobacteria;c__Actinobacteria;o__Actinomycetales;f__Microbacteriaceae;g__Cryocola;s__ 0,002236303
    48 k__Bacteria;p__Bacteroidetes;c__Sphingobacteriia;o__Sphingobacteriales;f__;g__;s__ 0,002236303
    49 k__Bacteria;p__Bacteroidetes;c__Bacteroidia;o__Bacteroidales;f__Prevotellaceae;g__Prevotella;s__copri 0,002129812
    50 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Clostridia;o__Clostridiales;f__Ruminococcaceae;g__;s__ 0,002023321
    51 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Bacilli;o__Gemellales;f__Gemellaceae;g__;s__ 0,001916831
    52 k__Bacteria;p__Actinobacteria;c__Actinobacteria;o__Actinomycetales;f__Micrococcaceae;g__Rothia;s__mucilaginosa 0,001863586
    53 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Bacilli;o__Bacillales;f__Bacillaceae;g__Anoxybacillus;s__kestanbolensis 0,001863586
    54 k__Bacteria;p__Bacteroidetes;c__Sphingobacteriia;o__Sphingobacteriales;f__Sphingobacteriaceae;g__Pedobacter;s__cryoconitis 0,00181034
    55 k__Bacteria;p__Actinobacteria;c__Actinobacteria;o__Actinomycetales;f__Intrasporangiaceae;Other;Other 0,001757095
    56 k__Bacteria;p__Actinobacteria;c__Actinobacteria;o__Actinomycetales;f__Mycobacteriaceae;g__Mycobacterium;s__ 0,001757095
    57 k__Bacteria;p__Bacteroidetes;c__Flavobacteriia;o__Flavobacteriales;f__[Weeksellaceae];g__Cloacibacterium;s__ 0,00170385
    58 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Clostridia;o__Clostridiales;f__;g__;s__ 0,00170385
    59 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Betaproteobacteria;o__Burkholderiales;f__Alcaligenaceae;g__;s__ 0,00170385
    60 k__Bacteria;p__Bacteroidetes;c__Cytophagia;o__Cytophagales;f__Cytophagaceae;g__Hymenobacter;s__ 0,001650604

    продолжение далее
     
  9. serg28

    serg28 Administrator

    Сообщения:
    2.226
    Адрес:
    Санкт-Петербург
    Болен:
    с 91 г.
    61 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Bacilli;o__Lactobacillales;f__Enterococcaceae;g__Enterococcus;s__cecorum 0,001650604
    62 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Gammaproteobacteria;o__Xanthomonadales;f__Xanthomonadaceae;g__;s__ 0,001597359
    63 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Alphaproteobacteria;o__Sphingomonadales;f__Sphingomonadaceae;g__Novosphingobium;s__ 0,001544114
    64 k__Bacteria;p__Actinobacteria;c__Actinobacteria;o__Actinomycetales;f__Micrococcaceae;g__Kocuria;s__palustris 0,001437623
    65 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Gammaproteobacteria;o__Xanthomonadales;f__Xanthomonadaceae;g__Pseudoxanthomonas;s__mexicana 0,001384378
    66 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Alphaproteobacteria;o__Sphingomonadales;f__Sphingomonadaceae;g__Kaistobacter;s__ 0,001331133
    67 k__Bacteria;p__Bacteroidetes;c__Sphingobacteriia;o__Sphingobacteriales;f__Sphingobacteriaceae;g__;s__ 0,001277887
    68 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Bacilli;o__Lactobacillales;f__Lactobacillaceae;g__;s__ 0,001277887
    69 k__Bacteria;p__Actinobacteria;c__Actinobacteria;o__Actinomycetales;f__Dietziaceae;Other;Other 0,001224642
    70 k__Bacteria;p__Actinobacteria;c__Actinobacteria;o__Actinomycetales;f__Micrococcaceae;g__Micrococcus;s__ 0,001224642
    71 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Alphaproteobacteria;o__Sphingomonadales;f__Sphingomonadaceae;g__Sphingopyxis;s__ 0,001171397
    72 k__Bacteria;p__Bacteroidetes;c__Bacteroidia;o__Bacteroidales;f__[Paraprevotellaceae];g__Paraprevotella;s__ 0,001118151
    73 k__Bacteria;p__Actinobacteria;c__Coriobacteriia;o__Coriobacteriales;f__Coriobacteriaceae;g__Collinsella;s__aerofaciens 0,001064906
    74 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Alphaproteobacteria;o__Rhodobacterales;f__Rhodobacteraceae;g__Amaricoccus;s__ 0,001011661
    75 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Betaproteobacteria;o__Neisseriales;f__Neisseriaceae;g__Neisseria;s__cinerea 0,001011661
    76 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Gammaproteobacteria;o__Enterobacteriales;f__Enterobacteriaceae;g__Erwinia;s__ 0,00090517
    77 k__Bacteria;p__Chloroflexi;c__Ellin6529;o__;f__;g__;s__ 0,000851925
    78 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Betaproteobacteria;o__Burkholderiales;f__Comamonadaceae;g__Tepidimonas;s__ 0,000851925
    79 k__Bacteria;p__Bacteroidetes;c__[Saprospirae];o__[Saprospirales];f__Chitinophagaceae;g__Flavisolibacter;s__ 0,00079868
    80 k__Bacteria;p__Acidobacteria;c__iii1-8;o__DS-18;f__;g__;s__ 0,000745434
    81 k__Bacteria;p__Actinobacteria;c__Actinobacteria;o__Actinomycetales;f__Propionibacteriaceae;g__Microlunatus;s__ 0,000745434
    82 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Alphaproteobacteria;o__Rhodobacterales;f__Rhodobacteraceae;g__Paracoccus;s__marcusii 0,000692189
    83 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Gammaproteobacteria;o__Alteromonadales;f__[Chromatiaceae];g__Rheinheimera;s__ 0,000692189
    84 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Gammaproteobacteria;o__Pseudomonadales;f__Moraxellaceae;g__Acinetobacter;s__johnsonii 0,000692189
    85 k__Bacteria;p__Bacteroidetes;c__Bacteroidia;o__Bacteroidales;f__Bacteroidaceae;g__Bacteroides;s__uniformis 0,000638944
    86 k__Bacteria;p__Bacteroidetes;c__Bacteroidia;o__Bacteroidales;f__Porphyromonadaceae;g__Parabacteroides;s__ 0,000638944
    87 k__Bacteria;p__Bacteroidetes;c__Cytophagia;o__Cytophagales;f__Cytophagaceae;g__;s__ 0,000638944
    88 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Gammaproteobacteria;o__Xanthomonadales;f__Xanthomonadaceae;g__Lysobacter;s__ 0,000638944
    89 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Gammaproteobacteria;o__Alteromonadales;f__[Chromatiaceae];g__Alishewanella;s__ 0,000585698
    90 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Gammaproteobacteria;o__Pseudomonadales;f__Pseudomonadaceae;g__Pseudomonas;Other 0,000585698
    91 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Bacilli;o__Bacillales;f__Bacillaceae;g__Bacillus;s__ 0,000532453
    92 k__Bacteria;p__Bacteroidetes;c__Bacteroidia;o__Bacteroidales;f__[Barnesiellaceae];g__;s__ 0,000479208
    93 k__Bacteria;p__Bacteroidetes;c__[Saprospirae];o__[Saprospirales];f__Chitinophagaceae;g__Sediminibacterium;s__ 0,000479208
    94 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Alphaproteobacteria;o__Rhizobiales;f__Rhizobiaceae;g__;s__ 0,000479208
    95 k__Bacteria;p__Bacteroidetes;c__[Rhodothermi];o__[Rhodothermales];f__Rhodothermaceae;g__Rubricoccus;s__ 0,000425962
    96 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Bacilli;o__Bacillales;f__[Thermicanaceae];g__Thermicanus;s__ 0,000425962
    97 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Gammaproteobacteria;o__Alteromonadales;f__[Chromatiaceae];g__;s__ 0,000425962
    98 k__Bacteria;p__Actinobacteria;c__Actinobacteria;o__Actinomycetales;f__Nocardiaceae;g__Rhodococcus;s__ 0,000372717
    99 k__Bacteria;p__Actinobacteria;c__Actinobacteria;o__Actinomycetales;f__Tsukamurellaceae;g__Tsukamurella;s__ 0,000319472
    100 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Bacilli;o__Bacillales;Other;Other;Other 0,000319472
    101 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Clostridia;o__Clostridiales;f__Veillonellaceae;g__Megasphaera;s__ 0,000319472
    102 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Alphaproteobacteria;o__Rhizobiales;f__Methylocystaceae;g__;s__ 0,000319472
    103 k__Bacteria;p__Actinobacteria;c__Actinobacteria;o__Actinomycetales;f__Pseudonocardiaceae;g__Actinomycetospora;s__ 0,000266227
    104 k__Bacteria;p__Actinobacteria;c__Thermoleophilia;o__Solirubrobacterales;f__;g__;s__ 0,000266227
    105 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Clostridia;o__Clostridiales;f__Lachnospiraceae;g__Roseburia;s__faecis 0,000266227
    106 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Betaproteobacteria;o__Burkholderiales;f__Burkholderiaceae;Other;Other 0,000266227
    107 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Gammaproteobacteria;o__Pseudomonadales;f__Moraxellaceae;g__Enhydrobacter;s__ 0,000266227
    108 k__Bacteria;p__Actinobacteria;c__Actinobacteria;o__Actinomycetales;f__;g__;s__ 0,000212981
    109 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Bacilli;o__Lactobacillales;f__Lactobacillaceae;Other;Other 0,000212981
    110 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Alphaproteobacteria;o__Sphingomonadales;f__Sphingomonadaceae;g__Sphingomonas;s__yabuuchiae 0,000212981
    111 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Betaproteobacteria;o__Burkholderiales;f__Comamonadaceae;Other;Other 0,000212981
    112 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Betaproteobacteria;o__Burkholderiales;f__Oxalobacteraceae;Other;Other 0,000212981
    113 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Gammaproteobacteria;o__Pseudomonadales;f__Pseudomonadaceae;g__;s__ 0,000212981
    114 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Bacilli;o__Bacillales;f__Planococcaceae;g__;s__ 0,000159736
    115 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Clostridia;o__Clostridiales;f__Clostridiaceae;g__;s__ 0,000159736
    116 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Clostridia;o__Clostridiales;f__Lachnospiraceae;g__Blautia;s__ 0,000159736
    117 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Clostridia;o__Clostridiales;f__Ruminococcaceae;g__Ruminococcus;s__bromii 0,000159736
    118 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Alphaproteobacteria;o__Caulobacterales;f__Caulobacteraceae;Other;Other 0,000159736
    119 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Gammaproteobacteria;o__Enterobacteriales;f__Enterobacteriaceae;g__Escherichia;s__coli 0,000159736
    120 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Gammaproteobacteria;o__Xanthomonadales;f__Xanthomonadaceae;g__Stenotrophomonas;Other 0,000159736
    121 k__Bacteria;p__Actinobacteria;c__Actinobacteria;o__Actinomycetales;f__Microbacteriaceae;g__Agrococcus;s__jenensis 0,000106491
    122 k__Bacteria;p__Actinobacteria;c__Actinobacteria;o__Actinomycetales;f__Micrococcaceae;g__Arthrobacter;s__ 0,000106491
    123 k__Bacteria;p__Bacteroidetes;c__Bacteroidia;o__Bacteroidales;f__Bacteroidaceae;g__Bacteroides;s__fragilis 0,000106491
    124 k__Bacteria;p__Bacteroidetes;c__Bacteroidia;o__Bacteroidales;f__[Odoribacteraceae];g__Butyricimonas;s__ 0,000106491
    125 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Bacilli;o__Bacillales;f__Bacillaceae;g__Bacillus;s__cereus 0,000106491
    126 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Bacilli;o__Bacillales;f__Staphylococcaceae;g__Staphylococcus;s__epidermidis 0,000106491
    127 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Clostridia;o__Clostridiales;f__Ruminococcaceae;g__Oscillospira;s__ 0,000106491
    128 k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Erysipelotrichi;o__Erysipelotrichales;f__Erysipelotrichaceae;g__;s__ 0,000106491
    129 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Alphaproteobacteria;o__Sphingomonadales;f__Sphingomonadaceae;g__;s__ 0,000106491
    130 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Alphaproteobacteria;o__Sphingomonadales;f__Sphingomonadaceae;g__Sphingobium;s__ 0,000106491
    131 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Betaproteobacteria;o__Burkholderiales;Other;Other;Other 0,000106491
    132 k__Bacteria;p__Proteobacteria;c__Betaproteobacteria;o__Burkholderiales;f__Burkholderiaceae;g__Burkholderia;Other 0,000106491
     

Поделиться этой страницей

Яндекс.Метрика